La
unión de dos o más aminoácidos (AA) mediante enlaces amida origina
los péptidos. En los péptidos y en las proteínas, estos enlaces
amida reciben el nombre de enlaces peptídicos y son el
resultado de la reacción del grupo carboxilo de un AA con el grupo amino de
otro, con eliminación de una molécula de agua (Figura de la izquierda).Cuando
los AA se encuentran formando parte de una cadena polipeptídica se suelen
denominar residuos, para diferenciarlos de su forma libre.
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Cuando
el péptido está formado por menos de 15 AA se trata de un oligopéptido (dipéptido,
tripéptido, etc.). Cuando contiene entre 15 y 50 AA se trata de un polipéptido y
si el número de AA es mayor, se habla de proteínas. En los
seres vivos se pueden encontrar proteínas formadas por más de 1000 AA.
Independientemente de la
longitud de la cadena polipeptídica, siempre habrá un grupo NH2 que
no ha reaccionado (el extremo amino) y un grupo COOH que tampoco
ha reaccionado (el extremo carboxilo).
La
formación de los enlaces peptídicos da lugar a la cadena principal o
esqueleto de la proteína, en la que la unidad repetitiva
básica está formada por el -NH- (del grupo amino),
el Ca (con su hidrógeno y su cadena lateral) y
el -CO- del grupo carboxilo (recuadro de color morado en la
figura superior). A partir del esqueleto se proyectan las cadenas
laterales, responsables de sus propiedades químicas.
A la
hora de nombrar un oligopéptido se considera como AA principal al que
conserva el grupo carboxilo. El resto de los AA se nombran como
sustituyentes, comenzando por el AA que ocupa el extremo amino. Por ejemplo,
el tripéptido de la figura superior es Ser-Tyr-Cys se
denominará seril-tirosil-cisteína.
Para nombrar polipéptidos y proteínas, se recurre anombres
triviales que, en la mayoría de los casos, hacen referencia a su
función.
Se
denomina secuencia de un péptido o de una proteína al orden
de los AA que lo integran. La secuencia viene determinada por:
1.- qué
AA forman del péptido o proteína
2.- el
orden en que están ensamblados
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Los términos polipéptido y
proteína no siempre son equivalentes, puesto que algunas proteínas están formadas por
más de una cadena polipeptídica. Es el caso de la hemoglobina (Figura
de la izquierda). En este caso:
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